ある日、聖域では双子座兼海龍のカノンが幼児化してしまった。そのカノンを大人の姿に戻すため、昔から『薬師の島』として知られる無人島で薬草探しを命じる教皇シオン。
島の管理者メリッサは元冥闘士。過去、彼女の身に起きた悲劇を鑑み、友好的に協力を依頼したかったシオンだが、メリッサの聖域への憎悪は根深いものだった。

聖戦後、聖闘士と冥闘士は全員復活してます。
シオンと童虎は肉体年齢18歳。