中国の科挙(官僚試験)で郷試、会試、殿試の3段階で首席合格者をそれぞれ解元、会元、状元と呼び、それらをまとめて「三元」と呼んだことから来ています。

神話上では古事記に登場する天地創造の最初に生まれたとされている三柱の神様を指します。
・天之御中主神(アメノミナカヌシ)
・高御産巣日神(タカミムスビ)
・神産巣日神(カミムスビ)
これら三柱の神々は、万物の根源や宇宙の起源を象徴するとされています。



大三元で検索したら麻雀用語が出てきたので詳しく調べたら上記の2つが見つかりました。神様的には後者の方がそれっぽいですが、三柱を纏めた呼び方であって個人を指すものでは無いんですよね。どう解釈したらいいか悩む氏神名です。