九十九は「百に一つ足りない（99）」ことから「数が非常に多いこと」や「たくさん」を意味する言葉です。また、百(もも)の次(つぎ)という意味で「つぎもも」が変化して「つくも」になったともいわれます。

ちなみに古い道具や器に宿るとされる付喪神は「九十九神」とも書き、長い年月(99年)を経た道具に魂が宿るという意味から使われるそうです。