シドの拠点からクライヴの拠点に移った時チョコボたちの姿はなかったのでインビンシブル内ではなくて（船頭のオルボスもトルガルはともかくチョコボは大きいから乗せられないのでしょうし）拠点付近にそこもミドの浄化槽設置して小屋があるのかと思っています。
においがひっつくでしょうし。
アナベラが少年期で鼻を抑えながら語っていたのも近くに馬（チョコボ）たちがいるからでしょうね🐥