この世とあの世の狭間を流れる三途の川に棲む妖怪・外道衆。

外道衆は遥かな昔から人間たちを襲い苦しめてきたが、300年前（1709年）より外道衆と戦い続けてきた者たちがいた。

彼らの名は侍戦隊シンケンジャー。

志葉家の当主とその家臣で構成された“侍”たちである。
彼らはモヂカラと呼ばれる不思議な力を操りながら戦い、先代当主の時代には、外道衆の大将・血祭ドウコクの封印に成功した。

忘れてはいけないのが‥‥
先代の時代までは存在していた
志葉家につかえる家臣がもう一つあった

その家臣の苗字は代々「夜神家」が受け継いでいる
夜神家は少し特殊な力を宿した一族で
正しきものに力を使えば平和へ
悪しきものに力を使えば崩壊へ

導かれる…巫女の力を宿した

一族なのである
しかし誰もが選ばれるわけではない‥‥
夜神家であっても相応しいものが一人
選ばれるのだ‥‥

先代ではたった一人の女性が選ばれて
一時は平和が保たれた‥‥
しかし夜神一族は何故か全滅し

生き残った者はいないが‥‥今も尚
その家系があったと語り継げられている‥‥。

時は流れ2009年。志葉家の現当主を務める志葉丈瑠は、当初はシンケンレッドとして一人で外道衆と戦っていたが、

外道衆の本格的な攻勢が始まることを察知した後見役の日下部彦馬は、

いずれ一人での戦いに限界が来ることを危惧し、家臣の子孫である4人の若者を招集をしようとすると

志葉家に不思議な少女が倒れており…

その少女を保護することにした‥‥

その少女こそが‥‥
夜神家一族の生き残りであり

最後の選抜者なのである‥‥

これは侍と家臣…そして少女の絆の物語である。