1章

　ある日主人公の入院している病院が虚に襲われる。それを助けたのが朽木　白哉だった。そこから主人公と白哉はお互いに交流し、仲を深めていく。
　そんな中、白哉の妹であるルキアが黒崎　一護に死神の力を与えたことで処刑されそうになっていると白哉から話を聞き、主人公は一護の伝手をたどって浦原商店へ。
　浦原商店で一時的に死神の力を与えられた主人公はルキアを助けに行くものの、ルキアを殺そうとしている藍染と遭遇。一戦を交える。白哉や他の死神の力でなんとかルキアを殺すことを阻止するも、一時的に死神になる力が消え、主人公は重体。
　主人公を助けるため白哉は死神の力を与え、無事に命は助かった。が、死神の力を与えたことで、総隊長から睨まれることとなってしまい、主人公は以前に見たことのある千本桜の霊力を真似る（始解）。一護やルキアの説得で、なんとか主人公と白哉は危機を脱するのだった。


2章

　死神の力を手にし、現世の病院に戻るものの何故か体の不調がさっぱりと消えていた。家に戻ろうとするものの両親は仕事で家におらず、肝心の家は草が生えて住める状況ではない。そのため朽木家に一時的に居候することとなった。
　そんな中、井上　織姫が虚圏に攫われる。主人公は織姫を助けに行こうとするルキアを補佐しつつ、自分も後から虚圏へ。
　無事に織姫を救出。
　ホッと安心したのも束の間。藍染が現世へ侵攻しようとしていることを知り、主人公は死神代行として白哉と離れ、虚圏から現世へ行くこととなった。


3章

　藍染と他の死神が戦っている真っ只中にとばされる。そこであっけなくやられていく死神の隊長たち。
　藍染は主人公との闘いの中で白哉との出会いがすべて崩玉の意思だと語る。
　ルキアの中に崩玉があったのなら、ルキアの周りにも影響が出る。ルキアの兄である白哉は前妻の緋真を救えず後悔していた。だからこそ、自分の力で救うことのできる主人公を見つけ、死神にしたことで救ったのだと。死神の力を分け与えて命を救われた存在。君は何者なのかーー。
　主人公は自分の存在に悩みつつも、藍染と戦っていく。その中で主人公は藍染の斬魄刀の力が「鏡花水月」、完全催眠であることを知らされる。
　主人公は戦いの中で卍解を使うが、自分の目で見ているものと斬魄刀の鏡の刀身に映っているものが違うと悟り、鏡花水月を打破する。
　だが完全体になった藍染は止められず、最終的に一護と浦原　喜助によって藍染は封印される。


4章

　尸魂界が藍染の反乱で忙しい中、朽木家にいることもできず。浦原商店でお金を稼ぎながら家に戻るの反復をしている主人公。
　ある日、石田　雨竜が襲われたことにより状況は一変。一護はすでに死神の力を失っているため頼らず、なんとか自分の力で事件を収集しようとする。
　雨竜の見舞いに行く中で、雨竜の父と主人公の両親が知り合いであることを知らされる。詳しく聞こうとするものの、事件を解決することが先決であるため先延ばしになってしまった。
　そのうちに雨竜だけでなく、織姫も襲撃されることに。犯人は完現術者（フルブリンガー）と呼ばれるものたちで、物質に宿った魂を引き出し、使役する能力を持っている。
　さらにその集団を指揮するリーダーは前の死神代であった。
　主人公もフルブリンガーの餌食となってしまい、主人公の完璧な記憶力に異質な過去を挿入されてしまう。そのせいで一護や助けに来た死神の白哉と戦うことになるが、周囲のおかげで記憶を上書きされ人格を壊されることはなくなり救われた。