本編
「僕と君・・・いや、僕らであいつを倒すんだ！行くよ、紀子！」
「分かったわ、レン！お願い、私達の『Ｇ』！」
「「ガメラ！」」
プロローグ‐雪の中のあの頃
1‐少年・能登沢憐太郎
2‐秘密基地の秘密
3‐あのさ、ちょっと亀見に来ない？
4‐6年振りの再会
5‐はじまりのおもいで
6‐帰ってきた「あの子」
7‐すれ違い
8‐ふたりの決意
9‐既視感
10‐「ガメラ」との出会い
11‐一世一代の・・・
12‐思いがけない再会、そして「嘘」
14‐眠る「カメ」と目覚める「クモ」
15‐巫子・守田紀子
16‐ガメラの正体
17‐ガメラVSクモンガ
18‐再びの別離
19‐あきらめるな！
20‐つがるのマブダチトリオ
21‐友情対兄弟
22‐告白
23‐験司の決断
24‐少年達の勇気
25‐玄武が「ガメラ」となる時
26‐玄武‐ガメラ‐覚醒
27‐リターンマッチ
28‐ブレイ・インパクト
29‐僕らの守護神
エピローグ‐愛のしるし
