本編
「・・・ボクとまた、一つになってくれ!ギャオス!!」
プロローグ‐守護神再び
1‐ガメラVSジーダス
2‐朱雀覚醒
3‐福江島
4‐レンと言う「魔法」
5‐Gnosis集合
6‐それぞれに秘めた秘密
7‐巫子・逸見樹
8‐樹の「性」
9‐地獄の逸見家
10‐錦糸町駅前居酒屋「ほのか」にて
11‐朱雀‐ギャオス‐降臨
12‐ガメラ対ギャオス
13‐説得
14‐紀子の決意
15‐真なる玄武
16‐亨平の怒り
17‐風来の女・アンマルチア
18‐晋と亨平
19‐土井平司、現る
20‐アンマルチアの正体
21‐ありのまま
22‐大人VS子供
23‐みぃちゃん
24‐ギャオス飛び去る
25‐エアロ・ボット
26‐傷付き倒れても・・・
27‐優しくなりたい
28‐もう一度、
29‐眠り姫を起こす為の術
30‐フェイズ2
31‐守護神(ガメラ)×母神(ギャオス)
32‐史上最大の父子喧嘩
33‐キルプロセス
34‐「想造」のパレッタ
35‐「想い」と言う力
36‐ガメラは、貴方を許さない。
37‐誰かの願いが叶う頃
38‐不安と安心
39‐・・・ギャオス、だよ。
エピローグ‐新しい逸見家の始まり